Как сравнить записи в 2х таблицах с одинаковой структурой...

Если говорим про СУБД уровня MySQL, то так:

SELECT table1.*
FROM table1
LEFT JOIN table2 ON table1.id = table2.id
WHERE table2.id IS NULL

Это будет работать везде, но в боле продвинутых СУБД есть встроенные операции получения разности множеств.

В Oracle для этого есть https://oracleplsql.ru/minus.html

В других базах - стандартный EXCEPT. Например, в PostgreSQL: https://postgrespro.ru/docs/postgrespro/9.5/queries-union