Будет отличаться. PyCharm делает свою виртуальную среду окружения по типу Venv. По своему опыту PyCharm, для извращенцев, используй Visual Studio Code инструмент значительно лучше и эффективней.
PyCharm — интегрированная среда разработки для языка программирования Python. Предоставляет средства для анализа кода, графический отладчик, инструмент для запуска юнит-тестов.