Если у Вас есть желание и навыки работы с базами данных, можете попробовать сначала самостоятельно оптимизировать запросы и таблицы для Вашей базы.
Для начала нужно получить полную статистику по процессам Вашей бд .Такую информацию можно получить от технической поддержки, либо самостоятельно, имея root доступ к серверу.
Быстрее всего информацию по процессам для базы данных на сервере можно получить с помощью панели управления WHMи функции MySQL Process List.
Проверку и оптимизацию таблиц базы данных можно выполнить через панель управления cPanel c помощью опций Check DB, Repair DB.
Также такую информацию можно получить, подключившись к серверу по SSH, используя команду mysqladmin proc stat
Оптимизировать базу данных также можно через SSH c помощью запуска команды mysqlcheck --repair --analyze --optimize --auto-repair db_name