Баротравмы происходят из за того, что в организме есть воздух, который под давлением расширяется. Самые распространенные связаны с ушными перепонками, вот тут подробнее в статье про это говорится:
http://seawolf.ru/barotravmy/. Насколько часто они случаются, ответить однозначно нельзя, инструктор обязан всех проинструктировать, как их избежать. То есть они случатся только если человек не соблюдает правила безопасности. Как то так