VBS, как сохранить в указанную строку.

Просто взять и записать как Вы хотите - никак. Представьте что у Вас в 25 строке было слово из 3ёх букв, а Вы хотите записать из 4. Как думаете кто будет сдвигать оставшийся хвост файла на 1 символ, чтобы слово не заехало на следующую строку? Правильно никто. Максимум можно записать по указанному смещению в файле поверх старых данных.

Так что либо перезаписывайте целиком файл, либо считайте смещение, перемещайтесь по файлу и записывайте с указанной позиции всё, либо это не текстовый (в традиционном понимании) файл.

И это не особенность VBS - не в языке дело.