Какую частоту дискретизации аудио выбирать при сведении аудио и видео для ютуба, 44100 или 48000?

Требования к кодированию *музыкальных* видео:
- кодек без компрессии (Linear PCM) или с компрессией без потерь (FLAC);
- дискретизация 44.1 kHz рекомендуется, а 48 и 96 допускается, но не обязательна:
- желателен 24-битный звук, но допускается и 16-битный.
Источник: https://support.google.com/youtube/answer/6039860?hl=ru

По факту, сейчас YouTube выдаёт звуковые потоки в формате webm (opus) с дискретизацией 48 кГц, а m4a - с частотой 44.1 кГц - для *всех* видео. Что именно будет использовано зависит от клиентского приложения.

Я бы рекомендовал использовать ту которая есть в исходном материале - чтобы избежать (потенциально) лишнего ресемплинга. Если есть возможность выбора формата звука при записи - то 48.