Если хочется меньше "мусора" - то да. А так не обязательно, но желательно, а лучше вообще Secure Erase хардварный сделать, возможно будет меньше нестабильных "блоков" :).
С такими вопросами лучше самому не лезть, а доверится специалисту.. Ну а для общего развития. Для уменьшения хлама и корректной работы, в процессе установки системный диск форматируется.