Можно ли писать PHP и MySQL в обычном блокноте???

Можно.

Да, я разрешаю, но лучше в тетради в клеточку 48 листов

Можно не то что в блокноте, можно прямо в терминале шарашить!

Любые скриптовые файлы можно писать в обычном блокноте

можно но проблематично т к IDE обычно умнее человека и сразу подсвечивает красным синтаксические ошибки опечатки и явные косяки в логике программы и интеграции с остальным окружением а блокнот ничего этого не делает - если сможешь написать идеальный код без ошибок и косяков то тогда можно писать в блокноте но как показывает практика такой код может быть только автогенерируемый ))