Есть ли преимущества Amperka Iskra JS перед Arduino Uno?

наверно не поймёшь ни слова, в амперке 32-х разрядный микроконтроллер на архитектуре ARM, в ардуине 8-ми разрядный AVR.
сравнение "лучше" и "хуже" здесь не уместно, они для разных задач.

AVR древняя архитектура и пора бы уже забыть про нее STM32 гораздо свежее, с гораздо большими возможностями и меньшим энергопотреблением.