Через Самозанятого нельзя сдавать в суб. аренду нежилое помещение или рабочие места :
пп. 3 п. 2 ст. 6 422-ФЗ
Для целей настоящего Федерального закона не признаются объектом налогообложения доходы:
3) от передачи имущественных прав на недвижимое имущество (за исключением аренды (найма) жилых помещений);
http://www.consultant.ru/document/cons_doc_LAW_311977/27164c06aa904117df15dede95fb55764e9054e7/