В каком порядке Проходить/Смотреть Данганронпу?

Так смотри

Сначала игра/аниме по первой части. Потом игра Goodbye Despair. Далее Danganronpa Another Episode: Ultra Despair Girls (важный спин-офф для понимания аниме). Далее, собственно, аниме. Смотреть так: одна серия Будущего, одна - Отчаяния. Дальше эпизод "Надежда".
Дополнительное:
Можно ОВУ про Нагито, но это не обязательно. Далее Danganronpa/Zero, рассказывающая о Джунко (это по желанию, но из всех дополнительных штук контента по этому больше всего). Есть еще Danganronpa Kirigiri, если вам интересна Киригири. Есть также Danganronpa KillerKiller - манга, которую все хейтят, хахах. Есть на русском. Вроде что-то про Ясухиро идет после прохождения Отчаянных девочек. По желанию IF в любое время.

Наконец Danganronpa V3. Пускай там и отдельная сюжетная линия, но отсылок на прошлые части пруд пруди (даже аниме). Так что знакомиться с ней после двух предыдущих игр, аниме и спин-оффа.