Зачем этот разъем на материнке?

PCI-E карты могут питаться как от PCI-E шины (там есть набор питающих линий) , так и отдельным проводом от блока питания.

Так вот питание на слоты берется от общей линии +12в, которая поступает от ATX разъема 24пин.

Как видишь, до него далеко, и нужно всю линию тащить по плате на далекое расстояние.

Этот разъем - один из вариантов, как разгрузить разводку платы, сделав вместо силовых дорожек от АТХ приход питания отдельным разъемом.

Обязательно ли его включать, это написано в инструкции.