можно ли ездить по генеральной доверенности на снятом с учета авто с номерами транзит(снял с учета по ген.доверке)

Абсолютно не важно, состоит ли т/с на учёте, неважно также и то обстоятельство, что малограмотный помощник нотариуса указал в Г. Д. гос. рег. знак. и свидетельство о регистрации т/с, которые у вас были изъяты при снятии с учёта, важно лишь то, что Г. Д. совершена в отношении именно самого т/с, соответственно, пока ГРЗ "Транзит" действует претензий к вам быть не может, а когда срок их действия завершится, возникнут основания для штраф в 100р.