Как организовать хранение файлов на сервере, для андройд приложения

А облако находится где, не в интернете? Просто если не там, то это не облако.. а просто данные внутри телефона. Если хотите работать с данными из вне, то и соединение с ним должно быть если не по интернету, то по любому другому способу, вайфай, блютуз, ну банально по сети через маршрутизатор тоже можно...

Ну, если АндроЙд, тогда пусть и СеЙрвер +_-

Почти любой сервер, вернее, согласно rest api, отправляет данные в формате json. Если это сетевое приложение, то данные берутся от сервера, где есть api, что-то типо http://127.0 .0.1:8080/api/methods/get.friends?user_id=00000, в теории данный метод должен вернуть в браузере строку, на подобие такого содержания {response: {friends_id: [1,2,3,4,5]}}, такая же строка вернется в java коде:
Scanner json = new Scanner(new URL("http://127.0 .0.1:8080/api/methods/get.friends?user_id=00000").openConnection().getInputStream());
Далее эта строка парсится на наличие данных с помощью библиотеки org.json или записывается в java объект с помощью Jackson fasterxml библиотеки

Тут нету ответов адекватных. Ты видимо основательно углубился в разработку Андроида, раз такие требования и мысли выдвигаешь. Но странно что не знаком с REST API. Вот это тебе и нужно)
Но свой бэкенд это дорого и сложно, раз ты в первый раз.
Можешь заюзать бесплатные сервисы Firebase. У них есть готовые БД, в которых ты бы мог что-то хранить