Отключаются ли sata при установке ssd m2 в материнку b450m pro pro vdh max

нет

если порт М2 работает параллельно, то один порт SATA может не работать

нет

В описании все расписано
Ниче не отключается
Это у тех у которых 6 сата дырок на бюджетных чипсетах, две отваливаются при подключении м. 2 сата

Не отвалится, на чипсете B450 6 линий SATA, а у тебя на материнке 4 порта (линий свободных хватает, потому производитель не вешает M.2 слот на общую шину с каким-нибудь из SATA-портов).