Добрый день. Подскажите как можно обновить 1000+ пк с windows xp до windows 10.

Жалко вы не сказали, надо ли сохранять данные.
Если надо сохранить данные и учетные записи, то через обновление.
Тут вы встретите грабли следующего характера:
1. вам придется обновиться сначадо до 7, а потом с 7 до 10.
2. чтобы не вводить на тысяче компов одни и те же данные при установке, надо подготовить установочный образ (создать unattended answers и как-то там внедрить его в установку).
3. Чтоб не бегать по тысяче компов со флешкой, возможно стоит создать PXE сервер для загрузки компов по сети, где они будут разово грузиться из сети, получать подготовленный образ установщика (сначала 7, а потом еще и 10)
Если сохранять данные не надо, то просто ставите 10 поверх имеющегося (без обновления до 7 и далее), скорее всего тоже с unattended answers в подготовленном дистре.