Почему как записывают формулу вещества пишут вот так? H3C-CH2-Ch2-Ch3, а не CH3-CH2-Ch2-Ch3

Правильно да как в первом случае, потому что углерод связан с углеродом, что и показано первая формула, во второй мы знаем, что он с углеродом связан и понимаем эту запись, но фактически запись показывает, что углерод связан с водородом