Почему MKVToolNix или Mkvmerge GUI такая кривая программа?

Есть функция разделения фильмов (или роликов) по таймкодам. Например, мне нужно обрезать фильм (титры вначале и титры в конце) с 0:39 по 1:55:55. Обрезаю, а он в итоге обрезал с 0:45 по 1:56:11 (лишние секунды вначале и оставил ненужные в конце). Если пытаешься обрезать раньше, отнимая по секунде, он нисколько не обрежет как тебе надо, а всё будет так же с 0:45 по 1:56:11. И только ты укажешь где-то 0:30-1:55:45, он обрежет опять с погрешностью в 6-10 сек (всегда разная погрешность и не угадать). Бывает обрезает почти точно (до погрешности в 1 сек). Чё с этой программой не так?
Пользоваться полноценными видеоредакторами невыгодно как по времени, так и по потери качества, плюс многие редакторы в процессе перекодирования теряют субтитры или доп.озвучки.