Когда беру крысу на руки, она иногда начинает облизывать пальцы, очень слабо кусать и метить... Из-за чего это?

Это способ общения. Метит - говорит, что мол мой человек. Покусывания - это выкусывает, говорит о вечной дружбе и преданности. Облизывает примерно по тем же причинам.