Как сделать, чтобы свой проект в фл студио открывался по умолчанию при открытии фл?

сохрани свой проект в папке C:\Program Files (x86)\Image-Line\FL Studio 12\Data\Projects\Templates
закрой FL, открой фл, загрузи проект из FILE > New from template, закрой и открой FL. Всё.

Возможно, у тебя папка Templates находится в другом месте. Найди её.