Выбрать FFmpeg video в настройках рендера, но

если кадров много, сцена сложная - Blender может вылететь и придется делать всё сначала. Поэтому для надежности стоит выставлять рендер в PNG, затем в самом же Blender склеить в одно видео в Videosequencer. После рендера в PNG снова выбрать FFmpeg video и сделать рендер. Отредерится быстро, ибо в секвенсере кадрый уже разложены