Купил жёсткий диск seagate на два ТБ, а там ещё один порт возле sata. Для чего он? у меня даже разъема такого нет. Фото

Это места для установки джамперов-перемычек и/или сервисный разъём для программатора/оборудования производителя.

В первом случае – их установка задаёт некие режимы, например, урезание ёмкости диска и т.д. В любом случае – это всё НЕ для пользователя предназначено, не надо туда лезть.

На дисках IDE (PATA), в отличие от SATA, подобными перемычками действительно пользователь выбирал какой диск будет главным (master), а какой второстепенным (slave) – так как там на один шлейф к одному разъёму материнской платы подключались ДВА диска. А у SATA – такого в принципе нет!