В настройках проекта:

И при выводе [Deliver]:

Укажите, что видео имеет вертикальную ориентацию. Соответствующие "галки" помечены красными стрелочками.
P.S. Исходное видео, естественно, тоже должно быть "вертикальным"! Если оно уже "искалечено", и чем-то / где-то / как-то "вписано" в горизонтальный формат, то процедура будет сложнее: понадобится, например, во вкладке [Edit] "обрезать" лишние поля.