Как именно организм заставляет работать определенный орган, клетку?

Очень подробно занялся анатомией, вплоть до того, что полез в цитологию. Хочу разобрать от самых маленьких структур (атомы, молекулы из которых состоят те или иные органелы клетки) и дойти до самых больших уровней организации жизни (в целом об органах по типу руки, ноги и т. д.)
Полез в химию. Разбираю сейчас молекулу ДНК подробно. Разобрал из каких частей состоят нуклеотиды, из каких атомов состоят азотистые основания, дезоксирибоза и остатки фосфорной кислоты. Сейчас меня волнует возможно тупой с позиции биологои вопрос или неоднозначный с философской точки зрения. А именно: как вообще все эти атомы в теле человека знают, с какими атомами в теле человека им нужно взаимодействовать, чтобы получилось, например, конкретное азотистое основание, да ещё и в нужном количестве, чтобы получился полноценный нуклеотид и определенное количество нуклеотидов потом, чтобы нуклеиновая кислота была определенная? Я понимаю, что нам это досталось от родителей по половым клеткам и у нас теперь это в соматических. Но вообще как условно говоря организм "включает" создание, например, нуклеотида? Это клетки мозга по нервам дают сигнал в определенную клетку организма, чтобы та создала этот нуклеотид для себя? Или сама по себе клетка может сама себе дать команду создать нуклеотид и ей для этого не нужно, чтобы ей это говорил головной мозг? Очень надеюсь, что мой вопрос понятен.