Выделение долей детям

Наверное, после исполнения 18 лет.

Если двум несовершеннолетним детям были выделены доли в доме по материнскому капиталу, то они могут подарить свои доли родителям, если они достигнут совершеннолетия и согласятся на это
Однако, если дети еще не достигли совершеннолетия, то родители могут выступать в качестве их законных представителей и управлять их долями в доме
Если вы купите квартиру на двоих детей, то они смогут подарить свои доли родителям только после того, как достигнут совершеннолетия и согласятся на это

с этим вопросом вам нужно обратится в опеку. Они рассмотрят насколько равноценны купленные доли в квартире и имеющиеся в доме. А так же обсудите что лучше - дарение или договор мены долями.
Но я бы посоветовала договором купли\ продажи - родители выкупают у детей доли и одновременно взамен приобретают им другое жилье.
Не обязательно ждать 18 лет -от имени детей в этом случае может выступить опека (представлять их интересы при сделке, так как родители являются сторонами сделки)
Но прежде чем что то покупать - сначала получите согласие опеки.

Несовершеннолетние не могут подарить свое имущество. Никому. А родителям и их близким родственникам даже продать не могут. И без разницы что там им ещё купят

Изначально согласие органа опеки истребуйте, если дети н/л и не смогут они вам ничего подарить.

Если задача в том, чтобы исключить детей из собственников дома, сделав их собственниками долей в указанной квартире - это возможно и достаточно просто. Но не тем способом, который Вы упоминаете в вопросе.

выделены доли двум несовершеннолетним детям по 25%

А зачем так? Цена дома = сумме средств по МК?