Счет не влияет на формирование проводок, поэтому его можно не проводить. И неважно, был ли он оплачен на 100% или частично. Однако, некоторые бухгалтерии ведут учет счетов и их оплат, например мы вносим счета от поставщиков и контролируем оплачен или не оплачен, и есть ли закрывающий документ. Подробнее можно узнать, например, тут:
https://buhexpert8.ru/1s-buhgalteriya/lajfhaki-dlya-buhgaltera/putevoditel-po-dokumentam/pokupki/dokument-schet-ot-postavshhika.html