Открылась и закрылась командная строка во время скачивания файла

Нет

Честно, не знаю, что это, но точно помню, что пару раз было такое при запуске ПК, но ничего не происходило

Не бойся, за тобой следит ФСБ.

Шейдеры-то зачем удалял. Судя по всему, экстренный релоад никаким боком не сыграл. Правильнее было задать вопрос там, где ты взял ссылку. .
Само по себе скачивание систему никак повредить не может, но ты же выбрал самый лёгкий путь. "Нажал и получил"
Конечно подобное поведение при загрузки никоим образом нормальным назвать нельзя. система "скомпроментирована"