Если вам не надо чтобы сэмпл звучал после окончания ноты, то настройте в сэмплере Envelope:

А если сэмпл короткий и перестаёт звучать раньше, чем кончается нота, то в сэмпле надо делать зацикленную область, как сказал Ванямба, но это не всегда может получиться.
Если использовать вместо сэмплов синтезаторы, то таких проблем не будет. Все ноты будут одинаковой и нужной длинны.