У ООО за год доходы 10 млн расходы 9.95 млн прибыль 50 000, хотя учред живет тысяч на 100 в мес. Есть за что подтянуть?

Он занижает прибыль очень просто и очень законно.
Он начисляет себе зарплату 100 тыс. руб. Вся зарплата идет в расходы предприятия, то есть, уменьшает прибыль.
Иметь зарплату 100 тыс. руб., это законно.

Возможно, у него есть наемные работники, и он им платит официальную зарплату. Если это так, то их официальная зарплата тоже увеличивает расходы ООО и уменьшает прибыль. Учитывать зарплату в качестве расходов, это не его желание, а закон. По закону зарплата учитывается в качестве расходов предприятия и поэтому, чем больше зарплата работников, тем меньше прибыль предприятия.

Обычно, прибыль занижают при помощи процедуры обналичивания через предприятия однодневки.