Если удалить Апк Файл и приложение то вирус останется?

Он не то чтобы останется он твой компухтер убьет

Вирус останется, т. к. с файла он переносится на твой комп, а значит если ты удалишь файл, то это ничего не изменит.
Ищи файл вируса, они часто сильно нагружают операционку.
Если не можешь найти файл вируса, то качай антивирусник Dr.Web. И смотри инструкцию по использованию