Если зарплата уже выплачена, но не начислена, после ее начислкния в 1с нужно ли создавать ведомость в банк?

Конечно же нужно, иначе у вас в 70-ом счете будет полный бардак.
А вообще лучше сначала проводить начисление, т.к. иначе из-за копеек могут "поплыть" и 70-ый и 68-ой счеты.