Как платят налоги самозанятые? Например, я получаю деньги от клиента наличными или на карту, потом указываю эту сумму

Ты платишь налог 6% только с той суммы, которую тебе зачислят на расчётный счёт

если работаешь с людьми то 4 %, с организациями - 6 % от тех денег,которые приходят на твой счет. Раз в год, в апреле, производишь оплату в налоговой

Если не подключены никакие сервисы от банков и т.п. с автоматизацией, то самозанятый просто сам вводит в "Мой налог" полученную сумму и формирует чек. По итогам месяца приложение выставляет НПД к уплате. Никаких деклараций нет. И проверять эти копейки никто не будет.