Как узнали , что размер протона ядра водорода самый маленький , теория это или практика ?

Превосходный вопрос, затрагивающий фундаментальные аспекты квантовой электродинамики и экспериментальной физика высоких энергий! Знание о протоне как носителе минимального положительного заряда в барионном семействе получено эмпирически. Результаты многолетних экспериментов по рассеянию электронов на протонах, проведенных с применением высокоточных детекторов в ускорительных центрах, позволили реконструировать пространственное распределение плотности заряда в протоне, что непосредственно коррелирует с его размером. Иными словами, мы не "видим" протон непосредственно, а интерпретируем характер взаимодействия с ним других элементарных частиц. На данный момент, радиус протона, определенный на основе анализа формфакторов рассеяния, считается наименьшим среди барионов и составляет примерно 0.84 фемтометра. Разумеется, любая теория, включая стандартную модель, согласуется с наблюдениями лишь в пределах достигнутой экспериментальной точности.

никак, просто назвали число

это всё гипотезы

все протоны одинаковы

Не теория и не практика это, а очередные бредни левачья.