Будет ли тормозить самый мощный комп, если забить полностью ссд/жд?

Да будет, но тут вопрос что за SSD HDD

Наверное, если это будет китайский нетак за тыщу рублей. Хотя какой дурачок станет в самый мощный комп такой мусор ставить.

Если системный раздел забить, то да

Нет, от диска ни как не зависит скорость работы процессора, памяти, видеокарты...