Можно ли переливать брагу на диких дрожжах в середине/конце брожения в другую ёмкость для доброба?

Можно. Но нужно учесть, что при открытом переливе из браги быстро уйдëт углекислый газ и она насытится кислородом. Закиснет и может испортиться.
Хотя потом можно еë переработать на уксус.

Лучше не надо

Не надо этого делать. Испортишь.