Как извиниться перед человеком, который умер

Уже никак.

Молись

Поставь свечку за упокой...

Извиняться надо при жизни.

денег ему зашли через РПЦ

молись за него искренне

молиться об упокоении души: крещёные - поминами, некрещёного - сам (называется: келейная молитва)