Можно ли HDD в корпусе будет лежать просто на нижней части корпуса, если нет салазок выше, это ему не вредно?

Нет

Вредно, вдруг ангиной заболеет

Только не храни на нем важную информацию

Да я просто сам крепёж делал из полосок оцинкованного железа.

Можно, ничего сильно плохого с жестким диском не случится.

Единственный момент - желательно подложить ножки из мягкого материала для гашения вибраций.

1). Можно, только сначала снизу под него подложи лист поролона, чтобы он гасил вибрации и чтобы что-то не коротнуло об железо!
2). И нужно обеспечить ему хорошее охлаждение и постоянно мониторить (отслеживать) температуру диска при помощи любой из множества утилит и программ, которые для этого предназначены!
3). Установи небольшой вентилятор в корпус системного блока, чтобы он обдувал этот HDD и будет всё хорошо!