Какое видео будет лучшего качества?

Исходник со 100 мбит лучше будет, так как при рендере всё равно происходит пересжатие видео по новой, а собственно и потеря качества. Исключения есть, но только в случаях если ты с несжатыми видеокодеками дело имеешь, типо ProRes, который весит овердофига.

Премьер про при экспорте h264 предлагает готовые пресеты для Ютуб видео. Там битрейт стоит 16 для фулки и 40 для 4К.
Этих значений и придерживайтесь.

То что вы говорите что-то там улучшится - нет.

Что значит "будет больше пикселей?" Битрейт на размер не влияет, эти параметры настраиваются ОТДЕЛЬНО.

Качество будет практически одинаковым, 16 Мбит/с в исходнике тоже достаточно много, на глаз будет не заметно. А пиксели ни при чём, их число зависит от размера кадра, а не от битрейта.