Что же лучше? uFiler или uTorrent

Наличие вирусов не зависит от торрент-клиента, это зависит от того, что ты через него скачиваешь. Вирусов нет изначально в обоих из них, хотя они в любом случае параша которыми лучше не пользоваться.
Скачай qBittorrent и будет тебе счастье

Так это просто торрент. Причем тут вирусы и торрент? Если в файле есть вирусы, то хоть через что качай, но их тоже установишь.

qBittorent, он с открытым исходным кодом, без рекламы и прочего, интерфейс очень похож на uTorrent, так что даже и не заметишь особой разницы