При съемке со стабилизатором, надо отключать стабилизацию на объективе и стабилизацию электронную в камере?

никто не знает ни какая у вас камера ни какой объектив. Научитесь задавать взрослые вопросы с исходной информацией в них.
А погадать - это в раздел "Магия и Гадания", а не к фотографам.

теоретически - да

С каким стабилизатором? с штативом может имеете в виду?..

ну смотря для чего.
Если тебе нужно снимать репортажку, просто ходить с камерой, где-то зумить и т.п., то лучше не отключать стабилизацию. Будет плавнее.
Если тебе нужно снимать какую-то художку, делать резкие движения стедиком, облёты, панарамирование и тому подобное, когда прям нужно крутить и изгаляться со стедиком, то нужно отключать. Ибо часто будет получаться такой противный эффект лесенки, когда внутрикамерный стабилизатор будет не успевать за движениями и будет как бы рывками догонять.

Речь про электронный стабилизатор? (стедикам?)
Да, нужно отключать, потому что про горизонтальных движениям он мешает постоянно будет елозить.