Почему раньше для програмирования микросхем использовали всякие костыли если USB помогает это делать быстрее?

Разве проггер висящий на COM или LPT порте костыль?) USB интерфейс весьма сложен, поэтому через него делается виртуальный порт uart, например с помощью Ch341, у той же китайской ардуины уже с той стороны платы стоит ch341)

Раньше технология USB была слаборазвита, и ей никто не пользовался, потому что скорость передачи данных такая же, как у дискет.
И это, судя по всему, программатор. Он проникает в любое место, и не каждый микрочип поддерживает USB из-за его громоздкости и сложности

USB - очень непростая штука, и малодоступная для любителей. COM и LPT-порты сильно проще. А заводское было не сильно доступно. Программатор стоил как деталь от космического корабля.

Раньше программировались или стирались утрафиолетом
http://prog.regionsv.ru/eprom.htm

юсб это и есть костыль,с преобразованием сигналов а прямое и самое надежное программирование это соm порт