UE5.5 после обновления нарушилась иерархия папок проекта

смотри, у тебя проблема с кодировкой папок после обновления анрила.
использование кириллицы — это ошибка, так как движок плохо ее обрабатывает, особенно при обновлениях.
и то, что при попытке переименования он крашнулся, вполне ожидаемо, так как движок пытается обновить ссылки.
лучше сделай следующее: скопируй все ассеты в отдельные папки с латинскими названиями, забудь о кириллице в путях проекта, и все ссылки будут работать нормально. если есть бэкап проекта то можешь пересохранить в новой версии и потом перекинуть ассеты из бэкапа. еще убедись, что проект сохранён через Source Control, так что ты сможешь откатить любые изменения.

слышь, у тебя явные проблемы с пониманием работы анрила и кириллицы. во-первых, не нужно переименовывать папки с кириллицей, если не хочешь геморроя. движок не всегда корректно работает с такими именами. во-вторых, ты пишешь, что при переименовании все ссылки сломались - так а как ты вообще хотел, чтоб было? ес-но, если ты путь к папке меняешь, то у тебя и ссылки ломаются. это как минимум банальная логика. чтобы это не сломалось есть редиректор ассетов. в третьих, вместо того, чтобы паниковать и писать мне тут, возьми да перетащи папки в контент браузере в нужную иерархию. анрил при перемещении автоматически перепишет все пути, и всё заработает, тебе же говорят, что пути правильные, только в браузере с отображением беда, зачем всё ломать пытаться? учи матчасть, иначе будешь набивать шишки и только ныть.