Как делают монтаж видео с 3д.обьектамѝ?

3d трэкинг есть на базовом уровне в афтер эффекте. Там легко можно заменить рекламный билборд или экран телефона / компьютера.
Для сложных эффектов, для синхронизации реальной камеры с футажа с виртуальной камерой в 3д пространстве - Cinema 4D.

Вроде бы ещё mocha часто упоминают (она есть в виде плагина для афтера), но её преимуществ я не знаю.