Скажите, если человек из магадана приехал сюда учиться, где ему можно в СПб получить паспорт?

Можно получить только при наличии у него здесь регистрации ( прописки) по месту жительства, если он прописан в Магадане то паспорт необходимо получать там. Если же он его потерял, то при обращении в районное отделение УФМС ему могут выдать удостоверение для проезда к своему месту жительства для востановления паспорта.