Подсажите. На полученный от завода-изготовителя ваккуумный насос имеется паспорт и сертификат

Вообще-то начальник всегда прав!
У нас в законодательстве этот вопрос не решен, поэтому и НЕ переписывание паспорта и его переписывание будет законным.
Многие между прочим так и делают. Вот Вы купили насос, а ведь там стоят детали изготовленные на разных заводах и предприятие собравшее этот насос выпустило его со своим паспортом, хотя получая комплектующие, на каждое это комплектующее (двигатели, клапана и т. п. ) был предоставлен свой паспорт.
Если насос будет эксплуатироваться на вашем же предприятии, то я не вижу смысла переписывать паспорт. Если на продажу, то тогда понять можно, а так.. .
Насос ведь наверняка гарантийный и гарантия будет обслуживаться по паспорту производителя насоса, а не по Вашему самописному.

Если не трудно сделай и забудь, дураков стоко-на всех штуцеров не хватит.