Причины строить Большой Адронный Коллайдер под землей следующие:
1) большая часть БАК - кольцевой тунель радиусом 27 км - на земле не пересекать его невозможно;
2) температура для его нормальной работы - на 2 градуса выше абсолютного нуля и под землей ее поддерживать легче;
3) супер-магниты для ускорения должны точно задавать необходимые условия для ускорения - влияние побочных магнитных полей недопустимо и обеспечить это можно только под землей.
Для скептиков: А что Вы знаете о русском коллайдере? -
http://www.bezfishki.net/2040-russkijj-kollajjder-byl-pochti-postroen-15-let.html