Могут ли лишить премии если я ушел на больничный на две недели?

Зависит от вашего положения о премировании в компании. Если премия завязана на фактически отработанном времени, то ее могут законно урезать пропорционально дням отсутствия. Полностью лишать премии только за сам факт болезни нельзя, это нарушение трудового кодекса.