Почему Бог велел истребить ханаанские племена?

Бог такого не велел.

Это жрецы так решили.

В ВОВ у немцев тоже были нашивки "С нами Бог". И это не мешало им зверствовать, им тоже сказали, что Бог хочет очистить мир от евреев.