Переводится ли ЗАГС на украинский??

Действительно РАГС:
вiддiл Реєстрації Актів Громадянського Стану.

Хотя написание РАКС и правда встречается достаточно
часто, видимо, к новой аббериватуре ещё не привыкли и
сказывается глухое произношение "г".

К слову сказать, в советское время аббревиатура была
та же, что и на русском: "запис актiв громадянського
стану" - ЗАГС.

То есть, переводить или нет, зависит от Вашей задачи.
Если важно подчеркнуть, что это сегодняшняя украинская реалия,
то РАГС. А если имеется в виду ЗАГС советского времени
или нынешний РФ-ский, тогда, конечно, ЗАГС - без перевода.