Конечно в гражданский районный федеральный суд по месту юридического адреса ответчика, поскольку Арбитражный суд рассматривает экономические споры между юридическими лицами, а здесь спор о возмещении ущерба в связи с дтп.
здесь есть образец заявления по ДТП Правда он между физическим и юридическим лицом, но его можно переделать под свой случай легко. Удачи в споре.